新皇崗口岸即將啟用，當局曾表示日後毋須再以穿梭巴士，連繫落馬洲共運輸交匯處和港深雙方口岸。皇巴士的營辦商表示，皇巴目前未有停運日期，又關注新皇崗口岸沒有設立旅遊巴上落客位置，相信新田會繼續成為旅行團集散地，期望當局考慮未來要如何處理旅行團旅客，又擔心專營巴士由巿區到達新田時已經客滿，未能處理旅行團龐大客量。
有服務皇巴超過26年的車長表示，對皇巴未來可能停運感到不捨。他憶述，曾經在颱風期間與20多名乘客下車，移走倒塌的大樹，讓皇巴士能繼續行駛，形容皇巴像第二個家 ，對未能擔任車長至退休感到失望。
亦有服務12年的客務主任指，隨著新皇崗口岸的開通日期越來越近，開始對皇巴士有機會消失感到失落。