瑜珈運動在國際愈來愈普遍，不過印尼伊斯蘭教的最高領袖，就禁止教徒參與瑜珈，認為部分瑜珈動作及歌曲，隱含印度教色彩，違反伊斯蘭教徒不得參與其他宗教活動的規定，但如果衹是純粹為強健身心而進行瑜珈運動就不受限制。其他伊斯蘭國家馬來西亞及埃及，亦有禁止信眾參加瑜珈的規定，有基督教原教旨主義者，亦曾批評瑜珈與他們的信仰有衝突。 在印尼，宗教禁令並沒有法律約束力，但是多數伊斯蘭教徒都會遵守，因為他們認為不遵守就等同犯罪。