日本氣象廳分析認為，熊本縣凌晨的七點三級地震，是近日地震的主震，並非餘震，前晚六點五級地震及之後的震動，只是前震。連日來的地震是內陸的活斷層，橫向錯位移動造成，由於震源深度只有約十公里，因此地表晃動特別強烈。
氣象廳表示，熊本地震的震源有向北側移動的趨勢，地震範圍亦擴大，呼籲整個九州的民眾要做好防災抗災準備。