審計署批評教育局旗下的優質教育基金管理不善，無定立成效目標和指標，以衡量成效；獲得撥款的學校、團體或個人，上年度有超過一半，在基金秘書處催促後，才提交監察報告；而受款人在核准預算內，調撥款項至另一項目，有七成是調撥後才再向秘書處申請。審計署說，基金應提醒受款人準時提交監察報告，並要事先取得批准才可調撥款項。 審計署又批評，基金轄下部份委員會，沒有訂定每年開會次數和法定人數，三個委員出席率亦偏低。教育局長同意審計署建議，會改善基金管理，並定期巡查監察，但強調要在問責，和避免不必要加重教師工作量之間，取得平衡。