國家衛生部發布秋冬季甲型H1N1新流感疫苗預防接種指導意見，指出疫苗適用於三歲以上人士；公共服務人員、學生及教師、慢性病患者等，獲優先考慮接種，至於孕婦，衛生部會根據國內外臨床實驗進展，提出意見。而疫情較重、人口密集及流動性大的地區，亦可優先開展接種工作。 衛生部亦要求各級機構和接種單位，接收疫苗時要查驗，審核疫苗生產及批發企業的資質；保存及運輸疫苗時，要保持在攝氏兩度至八度，避免凍結；接種前要告知受種者疫苗的不良反應等，嚴格實施一人一針一管。若出現異常反應，要立即報告及調查。