發展局因應早前向立法會發展事務委員會就蓮塘/香園圍口岸工程，申請追加撥款失敗後，再向委員會提交新建議，申撥總額較上次少三億，但仍超支逾八十一億，工程預算總額增至超過二百四十四億。
土木工程拓展署署長韓志强說，當局考慮過三個延後方案，試圖避開建築高峰期，以減低工程成本，結果發現，三個方案所涉開支，均較原方案高，亦會推遲口岸啟用時間達兩至三年，延長對附近居民的影響，認為不可取。