身兼西九管理局主席的政務司長林鄭月娥表示，高鐵工程延誤，主要影響車站上蓋，興建當代表演中心及中型劇場等第二批設施的工程，會同港鐵商討能否提早騰出土地，亦會要求先將高鐵工程集中在西九第三期工程的範圍，以便盡早取回用作私營發展住宅、寫字樓的地皮。她無回應政府會否向港鐵追討因工程延誤造成的損失，只指出目前政府仍未收回相關地皮，難以評估損失。
她又指，西九管理局將向立法會申請三億元，進行首階段M+綜合地庫的設計及前期工程，估計地庫耗資二百三十億，當局曾研究可否將地庫挖得更深，但面對技術及成本問題，故目前無計劃擴大地庫面積。多名議員批評，政府再申度請撥款，擔心西九開支失控，公眾難以接受。