審計報告批評，由民政事務局長提名的體育學院董事，包括民政局和康文署代表，在董事會和旗下委員會會議的出席率偏低，在一三至一四年度，康文署代表只出席了兩成董事局會議，另一名民政局代表，在其中一個委員會的四次會議，只出席了一次。另外有董事身任委員會成員，十三次會議中從來無出席，但之後再獲得延任。體院的一個委員會會議，曾經因為法定人數不足，需要押後。
報告又指，體院未有按承諾，每月向民政局提交帳目，而是每兩個月才提交；亦沒有每年提交活動計劃，而是因應審計署的查詢，才於今年年初將一零年至一四年的四個年度報告一次過交給局方。報告又批評，體院體育設施使用率不足，壁球場、田徑場和籃球場使用率不足三成。