日本首相安倍晉三在官邸會見到訪的國務委員楊潔篪，就中方申報《南京大屠殺檔案》作為世界記憶遺產，表達遺憾，指不能把焦點過度集中在過去的不幸歷史上，而是應構建面向未來的關係。楊潔篪作出反駁，指二戰事宜，國際已有定論，切實承認歷史十分重要。安倍與楊潔篪達成共識，中日同意妥善處理和管控重大敏感問題的分歧 ，及力爭早日啟用海上聯絡機制，避免兩國出現偶發性衝突。

楊潔篪此行又與日本國家安保局長谷內正太郎召開第二次中日高級別政治對話，中方官員透露，楊潔篪在會上闡述中方立場，敦促日方奉行積極的對華政策，妥善處理歷史問題，中方對日方干擾阻擾南京大屠殺檔案申遺表示強烈不滿，對於日本國會通過新安保法案，楊潔篪敦促日方堅持和平發展，不要做不利於地區和平穩定的事。他又重申中方在釣魚島和東海問題的立場，強調中方將堅決維護領土主權和海洋權益，願通過對話妥善管控和解決問題，又希望日方在南海問題謹言慎行。