到訪東京的菲律賓總統杜特爾特，傍晚與日本首相安倍晉三會談，雙方認同應基於國際法，和平化解南海主權爭議，杜特爾特在會面開始時說，在今日的會談不願意過多涉及南海問題，指現時不是談南海問題的時候，拒絕安倍要求菲方維持在南海問題對華強硬的原先立場，他又說，菲律賓與中國的關係只是經濟合作關係，不是軍事同盟，菲律賓在必要時，會站在日本一方，希望日本政府安心。安倍表示，希望菲律賓能夠遵循南海仲裁的立場，與日本加強在南海的防衛合作，他又對杜特爾特早前訪華，致力改善中菲關係表示歡迎。

杜特爾特與安倍並無談及日菲與美國的同盟關係。杜特爾特早前與日本界會面時，繼續發表反美言論，說希望美軍在兩年內撤出菲律賓。杜特爾特及安倍又見證日菲官員簽定防務及經濟合作文件，日方將提供巡邏船及T90訓練機，提升菲律賓在南海的警備能力，並承諾向菲律賓農業及基建提供支援。