來往本港及台灣的航機，受到風暴納沙和海棠影響，截至上午十一時，本港往返台北、台中、高雄以及花蓮的航班，有二十四班取消，三十一班延誤。國泰航空截至下午四時，本港來往台北有三班機取消，三班延誤；來往台中及高雄各有兩班延誤，呼籲旅客出發前先查詢。長榮航空表示，今日所有由台北出發的航班都取消，而香港出發只有BR828一班成行，呼籲旅客出發前，致電28109251查詢，除非確定成行，否則毋需前往機場。
有到內地公幹，經本港乘坐長榮班機回台灣的旅客說，來到香港才得知航班取消，但預約了明天看醫生，很焦急，航空公司職員只叫他耐心等候，致電航空公司又沒人接聽，批評公司無交待。有參加台北四天團的市民表示，乘坐的航班由早上十時多，延遲至下午三時多，擔心影響行程，亦感到無奈。